生物類廢物應根據其病源特性、物理特性選擇合适的容器和地點，專人分類收集進行消毒、燒毀處理，日産日清。
1. 一次性使用的制品如手套、帽子、工作物、口罩等使用後放入污物袋内集中燒毀。
2. 可重複利用的玻璃器材如玻片、吸管、玻瓶等可以用1000-3000mg/L有效氯溶液浸泡2-6h．然後清洗重新使用，或者廢棄。
3. 盛标本的玻璃、塑料、搪瓷容器可煮沸15min.或者用1000mg/L有效氯漂白粉澄清液浸泡2-6h，消毒後用洗滌劑及流水刷洗、瀝幹；用于微生物培養的，用壓力蒸汽滅菌後使用
4. 微生物檢驗接種培養過的瓊脂平闆應壓力滅菌30min，趁熱将瓊脂倒棄處理。
5. 尿、唾液、血液等生物樣品，加漂白粉攪拌後作用2-4h，倒入化糞池或廁所。或者進行焚燒處理。
6. 一般生物醫學實驗室分區的依據實驗因子污染的概率分區。